空襲部隊

• 第1航空戦隊; 「赤城」「加賀」
• 第2航空戦隊; 「蒼龍」「飛龍」
• 第5航空戦隊; 「瑞鶴」「翔鶴」

警戒隊

• 第1水雷戦隊; 「阿武隈」，第17駆逐隊（「谷風」「浦風」「浜風」「磯風」）
• 第18駆逐隊; 「陽炎」「不知火」「霞」「霰」
• (第5航空戦隊); 「秋雲」

支援部隊

• 第3戦隊第1小隊; 「比叡」「霧島」
• 第8戦隊; 「利根」「筑摩」

哨戒隊

• 第2潜水戦隊; 「伊19」
• (第3潜水隊); 「伊21」「伊23」

補給隊

• 第1補給隊; 「極東丸」「健洋丸」「国洋丸」「神国丸」
• 第2補給隊; 「東邦丸」「東栄丸」「日本丸」

ウェーク島攻略部隊

• 第6水雷戦隊; 「夕張」，第29駆逐隊（「追風(二代)」「朝風(二代)」「夕凪(二代)」），第30駆逐隊（「睦月」「弥生(二代)」「望月」）
• 陸戦隊; 舞鶴鎮守府派遣の1個中隊（内田中隊），第6根拠地隊の1個中隊（高野中隊），舞鶴鎮守府第2特別陸戦隊の1個中隊（板谷中隊）．他に各艦で臨時に陸戦隊を編成．
• 「第32号哨戒艇」（擱座），「第33号哨戒艇」（擱座），「天洋丸」「聖川丸」

航空部隊

• 第24航空戦隊; 千歳海軍航空隊，横浜海軍航空隊
• 「長田丸」

潜水部隊

• 「迅鯨」．ただしクエゼリン環礁での指揮．
• 第26潜水隊; 「呂号第61潜水艦」「呂号第62潜水艦」
• 第27潜水隊; 「呂号第65潜水艦」「呂号第66潜水艦」「呂号第67潜水艦」．ただし「呂66」は17日「呂62」との衝突事故で沈没．
• 第33潜水隊; 「呂号第63潜水艦」「呂号第64潜水艦」「呂号第68潜水艦」

ウェーク島攻略援護隊

• 第18戦隊; 「天龍」「龍田」

ウェーク島攻略増援部隊

• 第8戦隊; 「利根」「筑摩」
• 第17駆逐隊; 「谷風」「浦風」
• 第2航空戦隊; 「蒼龍」「飛龍」

ウェーク島攻略支援部隊

• 第6戦隊; 「青葉」「加古」「古鷹」「衣笠」